متن پیام رهبر معظم انقلاب اسلامی به شرح زیر است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت عالم بزرگوار مرحوم حجه‌الاسلام والمسلمین آقای حاج سیّد مهدی ابن‌الرضا اعلی‌الله‌مقامه را که سالهای متمادی در خوانسار به اداره حوزه‌ی علمیه و تربیت طلاب و تألیفات سودمند اشتغال داشتند به عموم مردم مؤمن و انقلابی خوانسار و بویژه خاندان محترم و آقازاده‌های مکرّم ایشان تسلیت عرض میکنم و رحمت و غفران الهی برای ایشان مسألت مینمایم.
متن پیام حضرت آیت الله خامنه‌ای به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت عالم مجاهد مرحوم حجه‌الاسلام آقای حاج شیخ علی برهان رحمه‌الله علیه را که بخش عمده‌ئی از عمر خود را در خدمت انقلاب سپری کرد و سالها در سنگر امامت جمعه به خدمات دینی و اجتماعی اشتغال داشت، به عموم مردم مؤمن و انقلابی مهریز و بخصوص به خانواده و بازماندگان محترم ایشان تسلیت عرض میکنم و رحمت و غفران الهی را برای ایشان مسألت میکنم.
سیّد علی خامنه‌ای
۱۵ / فروردین / ۹۶